出口企业在进行出口业务操作的时候，取得报关单、核销单、增值税认证发票以及专用税票等出口退税凭证，同时相关执法部门将相应的电子信息向上传递，通过中国电子口岸至国家税务总局，由国家税务总局通过其税务传输系统向下传递到基层的退税机关，有出口退税审核系统进行企业申报电子数据与执法部门电子底账的计算机比对。
出口企业根据相关规定，在货物报关出口并在财务上做销售后，将相关电子信息录入出口退税申报系统，生成申报表及电子数据，（通过远程申报系统）到退税机关预审，在进行纳税申报后，在退税机关申报办理退税。退税机关对企业申报数据进行逻辑审核及各外部信息对审。审核无误后，开具收入退还书（或者通过综合征管系统开具退还书），由国库将税款划给企业。
出口退税管理系统数据传递通过国税公共数据集中管理系统、国税电子数据传输系统出口退税系统以及出口退税管理系统内部数据传递机制实现。
出口退税电子税务局申报流程
第一步：在桌面找到“外贸企业出口退税申报系统”，双击进入。
第二步：录入用户名：SA ；密码为空（不填），点击“确认”进入申报系统。
第三步：录入企业的信息：海关企业代码、社会信用代码、纳税人识别号、企业名称均需填写，点击“确认”。（注意：三证合一前注册的企业纳税人识别号为15位，三证合一后注册的企业纳税人识别号与社会信用代码相同18位。）
（如电脑上未出现此步，表明此电脑已被其他企业使用，请将电脑重新启动后从第一步开始操作！）
第四步：录入当前所属期，所属期格式为“年份+月份”，办理《出口转内销证明》的所属期，是按照需转内销抵扣的增值税专用发票开具日期来确定，如：增值税专用发票开具日期为2019年3月15日，当前所属期可录入大于等于2019年3月、小于等于2019年12月的任一时期，即“201903”-“201912”均可，点击“确认”。提示：录入所属期年份与增值税专用发票开具日期年份应一致，如果申报多张发票不属于同一年份的，请按年份分别填报！
第五步：进入系统后，检查申报系统下方的企业信息是否正确，如不正确，请重启电脑后从第一步开始重新录入。检查左下方申报系统版本及商品代码库版本状态是否为“无需升级”（或拨打二分局服务热线，确定当前最新版本），如不是最新版本，请点击升级（安装运行版本升级文件）。
第六步：如果您已经是无纸化企业，务必配置好无纸化设置（如下步骤）后，再进行后续步骤；如您尚不是无纸化企业，请忽略本步骤，务必不要配置。
装税控设备的驱动程序，如电脑上已可正常使用税控设备，可跳过本步（大厅自助申报区电脑已安装驱动)。法律主观：
对外出口货物我国是不征收税费的，征收了也可以申请退税，但是必须要即使申报并携带报关单、出口销售发票等方面的材料进行办理。一、出口退税申报流程操作1、确认期：指的是什么时间+什么时间的出口，也就是你申报的是2018年5月6日的所属期，那下个月便要再度申请，不然就出不了口。2、认证发票的信息导入与处理：倘若是无认证设备的企业就得让退税的申报人录入，只需手动把税务机关认证的发票信息录入申报系统里就行了。3、至于出口明细申报数据的录入，就不详细介绍了，把出口产品的详细信息录入就OK。4、进货明细申报数据录入：进货的材料信息也是要录入的，别忘记了哦。5、三项检查：一、出口明细录入完成后——审核通过；二、进货明细录入完成后——审核通过；三、上面审核完成接下来就做三项关联检查了，如下：（1）进货出口数量关联检查；（2）换汇成本检查；（3）申报数据一致性检查。必须要等审核排查完成方可进行下一步，这几步也是必不可少的一部分。确认明细申报数据——预审——正式申报——打印申报文件。二、不予退税的情形国家明确不予退税的出口产品有：1、出口的原油；2、援外出口产品；3、国家禁止出口的产品；4、出口企业收购出口外商投资的产品；5、来料加工、来料装配的出口产品；6、军需工厂销售给军队系统的出口产品；7、军工系统出口的企业范围；8、对钻石加工企业用国产或进口原钻石加工的钻石直接出口或销售给外贸企业出口；9、齐鲁、扬子、大庆三大乙烯工程生产的产品；10、未含税的产品；11、个人在国内购买、自带出境的商品暂不退税。三、出口退税所需资料1、报关单。报关单是货物进口或出口时进出口企业向海关办理申报手续，以便海关凭此查验和验放而填具的单据。2、出口销售发票。这是出口企业根据与出口购货方签订的销售合同填开的单证，是外商购货的主要凭证，也是出口企业财会部门凭此记帐做出口产品销售收入的依据。3、进货发票。提供进货发票主要是为了确定出口产品的供货单位、产品名称、计量单位、数量，是否是生产企业的销售价格，以便划分和计算确定其进货费用等。4、结汇水单或收汇通知书。5、属于生产企业直接出口或委托出口自制产品，凡以到岸价CIF结算的，还应附送出口货物运单和出口保险单。6、有进料加工复出口产品业务的企业，还应向税务机关报送进口料、件的合同编号、日期、进口料件名称、数量、复出口产品名称，进料成本金额和实纳各种税金额等。7、产品征税证明。8、出口收汇已核销证明。9、与出口退税有关的其他材料。根据法律规定可以得知，出口退税申报在货物报关出口并在财务上作销售后，凭有关凭证按月报送税务机关批准退还或免征增值税和消费税。
法律客观：《增值税暂行条例实施细则》第三十七条 增值税起征点的适用范围限于个人。 增值税起征点的幅度规定如下： (一)销售货物的，为月销售额5000-20000元； (二)销售应税劳务的，为月销售额5000-20000元； (三)按次纳税的，为每次(日)销售额300-500元。 前款所称销售额，是指本细则第三十条 第一款所称小规模纳税人的销售额。 省、自治区、直辖市财政厅(局)和国家税务局应在规定的幅度内，根据实际情况确定本地区适用的起征点，并报财政部、国家税务总局备案。