出口单证备案中的国内运输发票不包含进仓费。
根据查询相关法律法规显示，准予抵扣的货物运费金额是指在运输单位开具的货票上注明的运费、建设基金，不包含随同运费支付的装卸费、保险费等其他杂费，进仓费属于杂费，不包括。
运输发票是运输单位提供运输劳务自行开具的运输业统一发票。
海运货代说有本地费用和进仓费是什么意思？
产品含税价格+内陆运费+货代的成本和其他成本+利润除以汇率就是含税进仓价价格。根据查询宁波人民官网得知，产品含税价格+内陆运费（FCL就是拖车费，LCL就是进仓费）+货代的成本（报关之类）和其他成本（寄单之类）+利润（是否含退税自己算）除以汇率就是含税进仓价价格。进仓库的物品含税，工厂进口材料的时候，会在海关将关税结算清楚，如果关税未付就到了工厂里，叫做含税进仓，这批货物该交关税还是要交的。
码头费用 收费标准按20多元到200多元每立方不等， 国外客户指定的货代一般码头费收费较高 ， 码头费包括好几种 ，可以让货代给你个明细，还有少部分报关费，单证费之类的
进仓费指的是将货物送到货代仓库的时候 进门收取的费用 按体积或者重量计费 ， 货多的话一般工厂付， 货少有可能是中间商付