外贸公司的报关代理费进行会计处理如下：
借：销售费用---报关费等
贷：其他应付款
一般情况下报关公司会代垫在报关报检过程中发生的费用，比如打单费、检疫费等（这个就算是自已报也要发生的），报关公司在开发票给你的时候会一并计算这些代垫的费用。所以一般意义上讲报关费含了报关公司的劳务费和代垫的费用。
货物的进口本钱＝进口合同的本钱价＋进口费用
进口的费用包括很多内容，假如以FOB条件从国外装运为根底，有如下内容：
一、国外运输费用：从出口国港口、机构或边境到我国边境、港口、机场等的海、陆、空的运输费用。
二、海运保险费用：上述运输途中的保险费用。
三、卸货费用：这类费用包括码头卸货费、起重机费、驳船费、码头建立费、码头仓租费等。
四、进口税货物在进口环节由海关征收（包括代征）的税种有：关税、产品税、增值税、工商统一税及中央附加税、盐税、进口调理税、对台贸易调理税、车辆置办附加费等。
1、关税：是货物在进口环节由海关征收的一个根本税种。
关税的计算公式为： 进口关税税额＝完税价钱（合同的到岸价）×关税税率
2、产品税、增值税、工商统一税、中央附加税： 都是在货物进口环节由海关代征的税种。
产品税、增值税和工商统一税3种税额的计算办法：
完税价钱＝（到岸价钱＋关税）／（1－税率）
应征税额＝完税价钱×税率
3、进口调理税：是对国度限制进口的商品或其他缘由加征的税种。其计算公式为：进口调理税税额＝到岸价钱×进口调理税税率
4、车辆置办附加费：进口大、小客车、通用型载货汽车、越野车、客货两用车、摩托车、牵引车、半挂牵引车以及其他运输车，均由海关代征车辆置办附加费，费率是15％。其计算公式是：计费组合价钱＝到岸价＋关税＋增值税 车辆购置附加费＝计费组合价钱×15％ 上述各种税金均以钱计征。
5、银行费用。我国进口贸易大多经过银行付款。银行要收取有关手续费，如开证费、结汇手续等。
6、进口商品的检验费和其他公证费。
7、报关提货费。
8、国内运输费。
9、利息支出。即从开证付款至收回货款之间所发作的利息。
10、外贸公司代理进口费。
11、其他费用，如杂费等。